בהתאם להחלטת הממשלה, באוקטובר 2003 אוחדו באופן רשמי המועצה המקומית "כוכב יאיר" והישוב "צור יגאל" שיצא מהמועצה האזורית דרום השרון. 

האיחוד, שעליו החליט לראשונה משרד הפנים בשנת 1998, כחלק מסדרת איחודי ישובים (שרובם לא יצאו בסופו של דבר לפועל), גרר תגובות ועתירות לבג"צ מהנהגות שני הישובים.

תושבי כוכב יאיר עתרו נגד האיחוד בטענה שיפגע בזכות הקניין שלהם. הם הסבירו כי מימנו מכיסם תשתיות ומוסדות קהילתיים, וכך ייהנו תושבי צור יגאל - יישוב שנמצא בפיתוח - מפירות השקעתם של השכנים. כמו כן טענו כי האיחוד יחסל את כוכב יאיר כיישוב כפרי קהילתי, ויתווה עיר קטנה שעלולה להפוך בעתיד לעיר גדולה.

מצד "הוועד המקומי צור יגאל", שהתנגד לאיחוד בתנאים הנתונים, אך הסכים לו בתנאים אחרים. הוגשה עתירה המבקשת להכריז על צור יגאל כעל רשות עצמאית, לקבל את תקציבי הפיתוח שהובטחו להם ושהמדינה תשלים את בניית התשתיות ומבני הציבור. 

בג"ץ איחד את שתי העתירות וביולי 2001 דחה אותן. הוא קבע שהאיחוד יתבצע לקראת הבחירות המוניציפליות ב-2003.